Post Doc in Entwicklung und Anwendung von Cloud-Basierten Analyze-Workflows für Lipidom- und Metabolomdaten (Forschungszentrum Jülich)

Verstärken Sie diesen Bereich zum nächstmöglichen Zeitpunkt als PostDoc - Entwicklung und Anwendung von Cloud-Basierten Analyze-Workflows für Lipidom- und Metabolomdaten (w/m/d) The Institut für Bio- und Geowissenschaften - Computergestützte Metagenomicik (IBG-5) Massenspektrometrie-Daten in den Bereichen Lipidomik und Metabolomik. Im Mittelpunkt steht der Einsatz von Cloud-Technologien, Algorithmen und KI zur Analyze großer Datenmengen und zur Unterstützung verschiedener Anwendungen in den Lebenswissenschaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 ist sowohl national (im Rahmen des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik-Infrastruktur - de.NBI) also auch international (als deutscher Knoten im Europäischen Bioinformatikverbund ELIXIR) in Service- und Infrastrukturnetzwerke eingebunden, um Datenanalysen für die wissenschaftliche Gemeinschaft als auch für den Endanwender effizienter und automatisierter zu gestalten. Institute issuing the offer: IBG-5 Your application: Arbeit an und Entwicklung von einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Lipidomik und Metabolomik und des Cloud-Computing Verarbeitung, Analyze, Integration und Interpretation von Lipidom- und Metabolomdaten verschiedener MS-Plattformen (Targeted und Untargeted, IMS) im Rahmen verschiedener Kooperationsprojekte (Genomic, Metagenomick, clinicische Forschung) Entwicklung von Analyze-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (zB Docker, Apptainer, S3, Openstack, Ansible) Mitarbeit im Bereich Human Data in nationalen und europäischen wissenschaftlichen Netzwerken (zB de.NBI, ELIXIR Europe). Dabei liegt der Fokus auf der Integration und Analyze von Humandaten, um die Zusammenarbeit und den Datenaustausch zwischen Forschungseinrichtungen zu fördern Unterstützung bei Planung, Entwicklung und Betrieb von Trusted Research Environments im Kontext der clinicischen Forschung Unterstützung & Beratung der de.NBI Cloud Governance bei Anträgen zur Nutzung der de.NBI Cloud zur Verarbeitung sensitiver Daten Unterstützung der Abteilung ELIXIR Germany im Bereich administrativer Projektarbeit wie dem Verfassen von Anträgen und Berichten und der Teilnahme an Projekttreffen Unterstützung der Abteilung ELIXIR Germany bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen für Wissenschaftler unterschiedlicher Karrierestufen und Fachbereichen Austausch mit internen und externen Projektpartnern am IBG-5, des Forschungszentrums, der Universität Bielefeld, sowie weiteren nationalen und internationalen Partnern Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften und Präsentation auf Konferenzen (Co)-Betreuung von Doktoranden. Your Profile: Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium und Promotion (PhD) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, oder Naturwissenschaften, oder eines verwandten Studiengangs Erfahrungen in der Entwicklung und Durchführung von Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows Sehr gute Kenntnisse in der Analyze von Metabolom - und / oder Lipidomdaten aus der Massenspektrometrie, gängiger Open Source Software, sowie Ansätzen zur Datenintegration von Multi-Omics Daten Gute Kenntnisse und Erfahrung im Umgang mit humanen Daten Sehr gute Programmierkenntnisse (zB in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse relevanter Technologien (zB Git, Docker, Nextflow) Sehr sicherer Umgang mit Linux/Unix Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft, sich in komplexe Themen einzuarbeiten Sehr zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil Good publications service Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung, ua durch die Unterstützung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen Bereitschaft zu Reisen und der Teilnahme an Konferenzen, Netzwerkveranstaltungen und Projekttreffen Our Partner: Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch: Einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet Umfassende Trainingsangebote und individuelle Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung Ein umfangreiches betriebliches Gesundheitsmanagement Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, zB im Homeoffice Flexible Arbeitszeitmodelle sowie eine Vollzeittätigkeit, die auch vollzeitnah ( https://go.fzj.de/vollzeitnah ) ausgeübt werden kann 30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr immer dienstfrei Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Stelle ist auf 3 Jahre befristet mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen nach dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (TVöD-Bund); in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung eine Eingruppierung im Bereich der Entgeltgruppe EG 13 - 14 TVöD-Bund. Alle Informationen zum Tarifvertrag des TVöD-Bund finden Sie auf der Seite des BMI: https://go.fzj.de/bmi.tvoed Die monatlichen Entgelte in Euro entnehmen Sie bitte dort auf Seite 66 des PDF-Downloads. Dienstort: Bielefeld Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, zB hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig. Die Position ist bis zur erfolgreichen Besetzung ausgeschrieben. Bitte bewerben Sie sich daher möglichst zeitnah. Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser Online-Bewerbungsportal! Fragen zur Ausschreibung? Kontaktieren Sie uns gerne über unser Kontaktformular Bitte beachten Sie, dass aus technischen Gründen keine Bewerbungen per E-Mail angenommen werden können. Pdf Wenn Sie sich auf diese Stelle bewerben, erwähnen Sie bitte dass Sie sie auf Universitoxy gesehen haben.

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PostDoc - Entwicklung und Anwendung von Cloud-Basierten Analyze-Workflows für Lipidom- und Metabolomdaten (w/m/d)

The Institut für Bio- und Geowissenschaften - Computergestützte Metagenomicik (IBG-5) Massenspektrometrie-Daten in den Bereichen Lipidomik und Metabolomik. Im Mittelpunkt steht der Einsatz von Cloud-Technologien, Algorithmen und KI zur Analyze großer Datenmengen und zur Unterstützung verschiedener Anwendungen in den Lebenswissenschaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 ist sowohl national (im Rahmen des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik-Infrastruktur - de.NBI) also auch international (als deutscher Knoten im Europäischen Bioinformatikverbund ELIXIR) in Service- und Infrastrukturnetzwerke eingebunden, um Datenanalysen für die wissenschaftliche Gemeinschaft als auch für den Endanwender effizienter und automatisierter zu gestalten.

Institute issuing the offer: IBG-5

Your application:

Arbeit an und Entwicklung von einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Lipidomik und Metabolomik und des Cloud-Computing
Verarbeitung, Analyze, Integration und Interpretation von Lipidom- und Metabolomdaten verschiedener MS-Plattformen (Targeted und Untargeted, IMS) im Rahmen verschiedener Kooperationsprojekte (Genomic, Metagenomick, clinicische Forschung)
Entwicklung von Analyze-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (zB Docker, Apptainer, S3, Openstack, Ansible)
Mitarbeit im Bereich Human Data in nationalen und europäischen wissenschaftlichen Netzwerken (zB de.NBI, ELIXIR Europe). Dabei liegt der Fokus auf der Integration und Analyze von Humandaten, um die Zusammenarbeit und den Datenaustausch zwischen Forschungseinrichtungen zu fördern
Unterstützung bei Planung, Entwicklung und Betrieb von Trusted Research Environments im Kontext der clinicischen Forschung
Unterstützung & Beratung der de.NBI Cloud Governance bei Anträgen zur Nutzung der de.NBI Cloud zur Verarbeitung sensitiver Daten
Unterstützung der Abteilung ELIXIR Germany im Bereich administrativer Projektarbeit wie dem Verfassen von Anträgen und Berichten und der Teilnahme an Projekttreffen
Unterstützung der Abteilung ELIXIR Germany bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen für Wissenschaftler unterschiedlicher Karrierestufen und Fachbereichen
Austausch mit internen und externen Projektpartnern am IBG-5, des Forschungszentrums, der Universität Bielefeld, sowie weiteren nationalen und internationalen Partnern
Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften und Präsentation auf Konferenzen
(Co)-Betreuung von Doktoranden.

Your Profile:

Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium und Promotion (PhD) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, oder Naturwissenschaften, oder eines verwandten Studiengangs
Erfahrungen in der Entwicklung und Durchführung von Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows
Sehr gute Kenntnisse in der Analyze von Metabolom - und / oder Lipidomdaten aus der Massenspektrometrie, gängiger Open Source Software, sowie Ansätzen zur Datenintegration von Multi-Omics Daten
Gute Kenntnisse und Erfahrung im Umgang mit humanen Daten
Sehr gute Programmierkenntnisse (zB in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse relevanter Technologien (zB Git, Docker, Nextflow)
Sehr sicherer Umgang mit Linux/Unix
Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft, sich in komplexe Themen einzuarbeiten
Sehr zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil
Good publications service
Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung, ua durch die Unterstützung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen
Bereitschaft zu Reisen und der Teilnahme an Konferenzen, Netzwerkveranstaltungen und Projekttreffen

Our Partner:

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:

Einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet
Umfassende Trainingsangebote und individuelle Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung
Ein umfangreiches betriebliches Gesundheitsmanagement
Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik
Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, zB im Homeoffice
Flexible Arbeitszeitmodelle sowie eine Vollzeittätigkeit, die auch vollzeitnah ( https://go.fzj.de/vollzeitnah ) ausgeübt werden kann
30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr immer dienstfrei

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr:
https://go.fzj.de/Benefits

Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Stelle ist auf 3 Jahre befristet mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen nach dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (TVöD-Bund); in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung eine Eingruppierung im Bereich der Entgeltgruppe EG 13 - 14 TVöD-Bund. Alle Informationen zum Tarifvertrag des TVöD-Bund finden Sie auf der Seite des BMI: https://go.fzj.de/bmi.tvoed Die monatlichen Entgelte in Euro entnehmen Sie bitte dort auf Seite 66 des PDF-Downloads.

Dienstort: Bielefeld

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, zB hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Die Position ist bis zur erfolgreichen Besetzung ausgeschrieben. Bitte bewerben Sie sich daher möglichst zeitnah. Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser
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