Gemeinsam besser. Fürs Leben. Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 17.000 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen. Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche. So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen. Willkommen im UKE. Wissenschaftliche:r Angestellte:r Junior / Doktorand:in (all genders) Computational Pediatric Oncology - Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum Job-ID: J000006971 Art der Anstellung: Befristet Arbeitszeit: Vollzeit/Teilzeit Bewerben bis: 05.10.2026 Unternehmensteil: UKE_Zentrum für Geburtshilfe, Kinder- u. Jugendmedizin Tätigkeitsbereich: Forschung & Wissenschaft Bereich: Klinik für Pädiatrische Hämatologie und Onkologie Das macht die Position aus Am Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf ist in der Arbeitsgruppe Computational Pediatric Oncology (Leitung Prof. Dr. Michael Bockmayr) zum 01.11.2026 eine Stelle als wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (PhD-Student) zu besetzen. Ein späterer Eintritt ist prinzipiell denkbar. Eine Promotion ist möglich und wird aktiv unterstützt. Die Stelle ist im Rahmen eines BMFTR-geförderten Juniorverbundprojekts zu besetzen, das in enger Kooperation mit der TU Berlin (Dr. Mina Jamshidi Idaji/Machine Learning Group) und der LMU München (Prof. Dr. Philipp Jurmeister/Computational and Molecular Pathology) durchgeführt wird. Im Mittelpunkt steht die Entwicklung neuartiger Methoden für das multimodale maschinelle Lernen in der computergestützten Diagnostik. Ziel ist die Integration histopathologischer, klinischer und molekularer Daten zur Optimierung KI-gestützter Entscheidungshilfen in der Onkologie. Eine professionelle und individuelle Betreuung wird über den gesamten Zeitraum gewährleistet. Darüber hinaus erwartet Sie im Forschungsinstitut ein motiviertes und dynamisches Team aus Ärzt:innen, Naturwissenschaftler:innen, Bioinformatiker:innen, technischen Assistent:innen und Studierenden, die im Rahmen unterschiedlicher Projekte und Ansätze der Erforschung kindlicher Krebserkrankungen auf der Spur sind. Ihre Aufgaben: Entwicklung und Evaluierung klinisch relevanter multimodaler Klassifikationsalgorithmen mit Methoden des maschinellen Lernens auf Basis von Bilddaten und hochdimensionalen Omics-Datensätzen Integration von histologischen, molekularen (Genomik, Epigenomik, Transkriptomik auf Bulk- und Einzelzellebene) und klinischen Daten Enge Zusammenarbeit mit den Kooperationspartner:innen und weiteren Forschungsgruppen am Kinderkrebszentrum Präsentation der Forschungsergebnisse auf internationalen Konferenzen und Veröffentlichung als Erstautor:in in anerkannten Fachzeitschriften Die Position ist drittmittel- und projektbedingt auf drei Jahre befristet. Darauf freuen wir uns Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium im Bereich Maschinelles Lernen, Bioinformatik, Informatik, Data Science, Angewandte Mathematik, Physik, Biomedical Engineering oder einem anderen relevanten Studiengang Nachgewiesene Programmiererfahrung in Python, gute Kenntnisse von ML-Frameworks wie PyTorch oder TensorFlow. Programmierkenntnisse in R sind vorteilhaft. Fundierte Kenntnisse aktueller Methoden des maschinellen Lernens Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeit und Fähigkeit zur interdisziplinären Zusammenarbeit Sichere Englischkenntnisse in Wort und Schrift, Deutschkenntnisse sind vorteilhaft Vorerfahrungen mit Representation-Learning, Transformer-Architekturen und erklärbarer KI (xAI) sind vorteilhaft Kenntnisse zur Verarbeitung von Omics-Daten und grundlegenden Methoden der Molekularbiologie sind vorteilhaft, aber nicht erforderlich. Für uns zählen vor allem Ihre fundierten Programmier- und ML-Kenntnisse Kenntnisse im Umgang mit UNIX-basierten Betriebssystemen und Versionskontrollsoftware sind wünschenswert Wir freuen uns auf eine aussagekräftige Bewerbung inkl. Motivationsschreiben, CV, Referenzen, Abschlusszeugnissen, Liste der besuchten Lehrveranstaltungen sowie ggf. Verlinkung von Code-Beispielen, Abschlussarbeiten oder Publikationen. Immunitätsstatus Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z. B. Impfausweis) nachzuweisen. Das bieten wir Faire und transparente Vergütung nach unserem Tarifvertrag TVöD/VKA (63.600 € - 91.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar. Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände Kontakt ins UKE Kontakt zum Fachbereich Herr Prof. Dr. Michael Bockmayr m.bockmayr@uke.de Kontakt zum Recruiting Recruiting Team +49 (0) 40 7410-52599 Über uns Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt. > Hier mehr zum Thema „Diversity im UKE“ erfahren. Wenn Sie sich auf diese Stelle bewerben, erwähnen Sie bitte dass Sie sie auf Universitoxy gesehen haben.

Gemeinsam besser. Fürs Leben.

Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 17.000 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen.

Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche. So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen.

Willkommen im UKE.

Wissenschaftliche:r Angestellte:r Junior / Doktorand:in (all genders) Computational Pediatric Oncology - Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum

Job-ID: J000006971
Art der Anstellung: Befristet
Arbeitszeit: Vollzeit/Teilzeit
Bewerben bis: 05.10.2026
Unternehmensteil: UKE_Zentrum für Geburtshilfe, Kinder- u. Jugendmedizin
Tätigkeitsbereich: Forschung & Wissenschaft
Bereich: Klinik für Pädiatrische Hämatologie und Onkologie

Das macht die Position aus

Am Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf ist in der Arbeitsgruppe Computational Pediatric Oncology (Leitung Prof. Dr. Michael Bockmayr) zum 01.11.2026 eine Stelle als wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (PhD-Student) zu besetzen. Ein späterer Eintritt ist prinzipiell denkbar. Eine Promotion ist möglich und wird aktiv unterstützt.

Die Stelle ist im Rahmen eines BMFTR-geförderten Juniorverbundprojekts zu besetzen, das in enger Kooperation mit der TU Berlin (Dr. Mina Jamshidi Idaji/Machine Learning Group) und der LMU München (Prof. Dr. Philipp Jurmeister/Computational and Molecular Pathology) durchgeführt wird. Im Mittelpunkt steht die Entwicklung neuartiger Methoden für das multimodale maschinelle Lernen in der computergestützten Diagnostik. Ziel ist die Integration histopathologischer, klinischer und molekularer Daten zur Optimierung KI-gestützter Entscheidungshilfen in der Onkologie.

Eine professionelle und individuelle Betreuung wird über den gesamten Zeitraum gewährleistet. Darüber hinaus erwartet Sie im Forschungsinstitut ein motiviertes und dynamisches Team aus Ärzt:innen, Naturwissenschaftler:innen, Bioinformatiker:innen, technischen Assistent:innen und Studierenden, die im Rahmen unterschiedlicher Projekte und Ansätze der Erforschung kindlicher Krebserkrankungen auf der Spur sind.

Ihre Aufgaben:

Entwicklung und Evaluierung klinisch relevanter multimodaler Klassifikationsalgorithmen mit Methoden des maschinellen Lernens auf Basis von Bilddaten und hochdimensionalen Omics-Datensätzen
Integration von histologischen, molekularen (Genomik, Epigenomik, Transkriptomik auf Bulk- und Einzelzellebene) und klinischen Daten
Enge Zusammenarbeit mit den Kooperationspartner:innen und weiteren Forschungsgruppen am Kinderkrebszentrum
Präsentation der Forschungsergebnisse auf internationalen Konferenzen und Veröffentlichung als Erstautor:in in anerkannten Fachzeitschriften

Die Position ist drittmittel- und projektbedingt auf drei Jahre befristet.

Darauf freuen wir uns

Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium im Bereich Maschinelles Lernen, Bioinformatik, Informatik, Data Science, Angewandte Mathematik, Physik, Biomedical Engineering oder einem anderen relevanten Studiengang
Nachgewiesene Programmiererfahrung in Python, gute Kenntnisse von ML-Frameworks wie PyTorch oder TensorFlow. Programmierkenntnisse in R sind vorteilhaft.
Fundierte Kenntnisse aktueller Methoden des maschinellen Lernens
Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeit und Fähigkeit zur interdisziplinären Zusammenarbeit
Sichere Englischkenntnisse in Wort und Schrift, Deutschkenntnisse sind vorteilhaft
Vorerfahrungen mit Representation-Learning, Transformer-Architekturen und erklärbarer KI (xAI) sind vorteilhaft
Kenntnisse zur Verarbeitung von Omics-Daten und grundlegenden Methoden der Molekularbiologie sind vorteilhaft, aber nicht erforderlich. Für uns zählen vor allem Ihre fundierten Programmier- und ML-Kenntnisse
Kenntnisse im Umgang mit UNIX-basierten Betriebssystemen und Versionskontrollsoftware sind wünschenswert

Wir freuen uns auf eine aussagekräftige Bewerbung inkl. Motivationsschreiben, CV, Referenzen, Abschlusszeugnissen, Liste der besuchten Lehrveranstaltungen sowie ggf. Verlinkung von Code-Beispielen, Abschlussarbeiten oder Publikationen.

Immunitätsstatus

Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z. B. Impfausweis) nachzuweisen.

Das bieten wir

Faire und transparente Vergütung nach unserem Tarifvertrag TVöD/VKA (63.600 € - 91.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar.
Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld
Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere
Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände

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Kontakt zum Fachbereich

Herr Prof. Dr. Michael Bockmayr
- m.bockmayr@uke.de

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Recruiting Team

+49 (0) 40 7410-52599

Über uns

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

> Hier mehr zum Thema „Diversity im UKE“ erfahren.

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