PostDoc für Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in Cloud-basierten Ausführungsumge (Forschungszentrum Jülich)

Verstärken Sie diesen Bereich zum nächstmöglichen Zeitpunkt als PostDoc - Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in Cloud-basierten Ausführungsumgebungen (w/m/d) Der Institutsbereich Computergestützte Metagenomik im Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG-5) widmet sich bioinformatischen Forschungsaktivitäten mit dem Fokus auf die interdisziplinäre Entschlüsselung und Analyse von Meta-Genomen. Schwerpunkt ist insbesondere der Einsatz von Cloud-Technologien zur Analyse großer Datenmengen und zur Unterstützung verschiedener Anwendungen in den Lebenswissenschaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 integriert dabei sowohl auf nationaler (de.NBI), als auch auf internationaler Ebene (ELIXIR) Service- und Infrastrukturnetzwerke, um solche Datenanalysen sowohl für die wissenschaftliche Gemeinschaft als auch für den Endanwender effizienter und automatisierter zu gestalten. Institute issuing the offer: IBG-5 Ihre Aufgaben: Arbeit an einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Metagenomik und des Cloud-Computing Verarbeitung, Analyse und Interpretation von Metagenomdaten verschiedener NGS-Plattformen (u.A. Illumina, ONT, PacBio) ihm Rahmen verschiedener Kooperationsprojekte Entwicklung von Analyse-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (z.B. Docker, Aptainer, S3, Openstack, Ansible) Unterstützung der Arbeitsgruppe im Bereich administrativer Projektarbeit wie dem Verfassen von Anträgen und Berichten und der Teilnahme an Projekttreffen Unterstüztung der Arbeitsgruppe bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen für Wissenschaftler:innen unterschiedlicher Karrierestufen und Fachbereichen Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften und Reisen zu Konferenzen Austausch mit internen und externen Projektpartnern am IBG-5 und der Universität Bielefeld (Co)-Betreuung von Doktoranden und Doktorandinnen Ihr Profil: Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, Natur- oder Wirtschaftswissenschaften, oder eines verwandten Studiengangs mit anschließender abgeschlossener Promotion Erfahrungen an Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows Gute Kenntnisse in der Sequenzanalyse und Metagenomik, insbesondere bei der Verarbeitung von Illumina und ONT Daten Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse relevanter Technologien (z.B. Git, Docker, Nextflow) Sehr sicherer Umgang mit Linux/Unix Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft sich in komplexe Themen einzuarbeiten Sehr zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil Gute Publikationsleistung Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung, u.a. durch die Unterstützung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen Bereitschaft zu Reisen und der Teilnahme an Konferenzen, Netzwerkveranstaltungen und Projekttreffen Unser Angebot: Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch: Hochinteressante, interdisziplinär angelegte, abwechslungsreiche Tätigkeit in einem hochaktuellen Themenkomplex Teilnahme an Projekttreffen und Konferenzen Starke Unterstützung und Mentoring für den Aufbau einer zukünftigen Karriere in der Wissenschaft und/oder der Industrie Weiterentwicklung Ihrer persönlichen Stärken, z. B. durch ein umfangreiches Trainingsangebot; ein strukturiertes Weiterbildungsprogramm und Vernetzungsmöglichkeiten speziell für Promovierende über JuDocS, das Jülicher Zentrum für Doktoranden und Betreuer: https://www.fz-juelich.de/judocs Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z. B. im Homeoffice, ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen gegeben Vermögenswirksame Leistungen und eine betriebliche Altersvorsorge 30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr immer dienstfrei Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Eine zunächst auf 2 Jahre befristete Stelle mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung im Bereich der Entgeltgruppe EG 13 nach dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (TVöD-Bund). Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig. Die Position ist bis zur erfolgreichen Besetzung ausgeschrieben. Bitte bewerben Sie sich daher möglichst zeitnah. Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser Online-Bewerbungsportal! Fragen zur Ausschreibung? Kontaktieren Sie uns gerne über unser Kontaktformular Bitte beachten Sie, dass aus technischen Gründen keine Bewerbungen per E-Mail angenommen werden können. Pdf Wenn Sie sich auf diese Stelle bewerben, erwähnen Sie bitte dass Sie sie auf Universitoxy gesehen haben.

Verstärken Sie diesen Bereich zum nächstmöglichen Zeitpunkt als

PostDoc - Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in Cloud-basierten Ausführungsumgebungen (w/m/d)

Der Institutsbereich Computergestützte Metagenomik im Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG-5) widmet sich bioinformatischen Forschungsaktivitäten mit dem Fokus auf die interdisziplinäre Entschlüsselung und Analyse von Meta-Genomen. Schwerpunkt ist insbesondere der Einsatz von Cloud-Technologien zur Analyse großer Datenmengen und zur Unterstützung verschiedener Anwendungen in den Lebenswissenschaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 integriert dabei sowohl auf nationaler (de.NBI), als auch auf internationaler Ebene (ELIXIR) Service- und Infrastrukturnetzwerke, um solche Datenanalysen sowohl für die wissenschaftliche Gemeinschaft als auch für den Endanwender effizienter und automatisierter zu gestalten.

Institute issuing the offer: IBG-5

Ihre Aufgaben:

Arbeit an einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Metagenomik und des Cloud-Computing
Verarbeitung, Analyse und Interpretation von Metagenomdaten verschiedener NGS-Plattformen (u.A. Illumina, ONT, PacBio) ihm Rahmen verschiedener Kooperationsprojekte
Entwicklung von Analyse-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (z.B. Docker, Aptainer, S3, Openstack, Ansible)
Unterstützung der Arbeitsgruppe im Bereich administrativer Projektarbeit wie dem Verfassen von Anträgen und Berichten und der Teilnahme an Projekttreffen
Unterstüztung der Arbeitsgruppe bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen für Wissenschaftler:innen unterschiedlicher Karrierestufen und Fachbereichen
Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften und Reisen zu Konferenzen
Austausch mit internen und externen Projektpartnern am IBG-5 und der Universität Bielefeld
(Co)-Betreuung von Doktoranden und Doktorandinnen

Ihr Profil:

Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, Natur- oder Wirtschaftswissenschaften, oder eines verwandten Studiengangs mit anschließender abgeschlossener Promotion
Erfahrungen an Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows
Gute Kenntnisse in der Sequenzanalyse und Metagenomik, insbesondere bei der Verarbeitung von Illumina und ONT Daten
Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse relevanter Technologien (z.B. Git, Docker, Nextflow)
Sehr sicherer Umgang mit Linux/Unix
Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft sich in komplexe Themen einzuarbeiten
Sehr zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil
Gute Publikationsleistung
Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung, u.a. durch die Unterstützung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen
Bereitschaft zu Reisen und der Teilnahme an Konferenzen, Netzwerkveranstaltungen und Projekttreffen

Unser Angebot:

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:

Hochinteressante, interdisziplinär angelegte, abwechslungsreiche Tätigkeit in einem hochaktuellen Themenkomplex
Teilnahme an Projekttreffen und Konferenzen
Starke Unterstützung und Mentoring für den Aufbau einer zukünftigen Karriere in der Wissenschaft und/oder der Industrie
Weiterentwicklung Ihrer persönlichen Stärken, z. B. durch ein umfangreiches Trainingsangebot; ein strukturiertes Weiterbildungsprogramm und Vernetzungsmöglichkeiten speziell für Promovierende über JuDocS, das Jülicher Zentrum für Doktoranden und Betreuer: https://www.fz-juelich.de/judocs
Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik
Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z. B. im Homeoffice, ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen gegeben
Vermögenswirksame Leistungen und eine betriebliche Altersvorsorge
30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr immer dienstfrei

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Eine zunächst auf 2 Jahre befristete Stelle mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung im Bereich der Entgeltgruppe EG 13 nach dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (TVöD-Bund).

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Die Position ist bis zur erfolgreichen Besetzung ausgeschrieben. Bitte bewerben Sie sich daher möglichst zeitnah. Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser
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Bitte beachten Sie, dass aus technischen Gründen keine Bewerbungen per E-Mail angenommen werden können.

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